Rupert studierte bei Christian Poltéra in Luzern und bei Thomas Demenga in Basel, wo er sein Studium mit Auszeichnung abschloss. Er unterrichtet an den Musikschulen Kulm und Beinwil am See Cello. Neben seiner Unterrichtstätigkeit spielt Rupert als Zuzüger in Orchestern wie dem City Light Symphony Orchestra und der Camerata Cantabile.